|
|
Testing of anti-microbial and anti-adhesive properties of nanodiamond materials
Jurková, Blanka ; Beranová, Jana (vedoucí práce) ; Lišková, Jana (oponent)
Nanokrystalické diamantové (NCD) filmy se vyznačují výbornými mechanickými vlastnostmi (nízkým koeficientem tření, velkou tvrdostí atd.), chemickými vlastnostmi (např. nízkou korozivitou či chemickou neaktivitou) a dobrou biokompatibilitou. Díky tomu se jeví jako perspektivní materiály pro ochranné vrstvy lékařských implantátů a pomůcek. Jelikož bakteriální biofilmy jsou často velmi rezistentní vůči léčbě, materiály s antibakteriálními nebo alespoň antiadhesivními vlastnostmi jsou velmi žádoucí, nicméně interakce bakterií s NCD nebyla doposud do hloubky zkoumána. Cílem této práce je představit a optimalizovat metody pro rutinní kultivaci bakteriálních biofilmů a jejich analýzu, pomocí těchto metod zjistit, zda jsou NCD schopné inhibovat adhezi a tvorbu biofilmu u Escherichia coli, a případně korelovat tuto schopnost s mírou hydrofobicity NCD povrchů. Materiály užité v této práci byly hydrogenovaný NCD (hydrofobní), oxidovaný NCD (hydrofilní) a čisté sklo. Pro růst biofilmů byla využita kultivace v šesti jamkových destičkách a v CDC Bioreaktoru. Pro odloučení bakteriálních biofilmů z povrchu bylo testováno hned několik metod. Domnělé antibakteriální vlastnosti NCD nebyly v této práci prokázány, naopak byla pozorována vyšší adheze k NCD filmům než ke sklu. Tento efekt by mohl být zapříčiněn vyšší...
|
|
|
Využití gelově-založených proteomových technik při analýze genové exprese u prokaryotních a eukaryotních modelů
Petráčková, Denisa ; Weiser, Jaroslav (vedoucí práce) ; Nešvera, Jan (oponent) ; Stulík, Jiří (oponent)
Tato dizertační práce ukázala možnosti využití gelově-separační techniky 2-DE při řešení tří nezávislých vědeckých projektů. Proteomické studie vhodně doplnily výsledky získané i jinými přístupy a přispěly k celkovému zobrazení proteinové situace v daných biologických systémech. Srovnáváním celkového proteomu E. coli bylo identifikováno 61 proteinových změn v souvislosti s vývojem bakteriální populace v přítomnosti antibiotika erytromycinu. Tento "klasický" experiment zahrnoval vhodnou izolaci vzorku, separaci a analýzu bílkovin pomocí 2-DE s následnou identifikací proteinů pomocí MS. Nevýhodou bylo velké množství výsledných dat, které bylo potřeba zpracovat (počítačovou analýzou dat). Naproti tomu v případě studia membránového proteomu B. subtilis při pH stresu bylo třeba primárně modifikovat metodu izolace membránových a s membránou asociovaných bílkovin pro jejich vhodnou separaci na 2-DE Optimalizace zahrnovala především úpravy v použitých chemikáliích-detergentech podílejících se na solubilizaci proteinů a časové prodloužení tohoto procesu. Detegováno bylo následně 5 významných proteinových změn v odpovědi na pH stres týkajících se proteinů AcoB, SodA, YjcH, YwaC a YkwC. Data byla doplněna údaji o rigidizaci membrány B. subtilis v kyselém prostředí (stanoveno pomocí pulzní časově rozlišená...
|
host ::
RSS.